Mikrobiologisk overvågning - Identifikation, karakterisering og kvantificering af mikroorganismer

Søren  Kahns

Jeg er din kontaktperson

Skriv til mig

Indtast venligst et validt navn
Eller dit telefonnummer
Sender besked
Tak for din besked
Vi beklager

På grund af en teknisk fejl kan din henvendelse desværre ikke modtages i øjeblikket. Du er velkommen til at skrive en mail til Send e-mail eller ringe til +45 72202732

Analyse af mikroorganismer i stinkskab

Mikrobiologisk overvågning - Identifikation, karakterisering og kvantificering af mikroorganismer

Kemisk og Mikrobiologisk Laboratorium har mange års erfaring med at identificere, karakterisere og kvantificere mikroorganismer i mange forskellige slags prøver. Som standard udfører laboratoriet en lang række analyser, som sammensættes således, at resultatet giver kunden det mest fyldestgørende svar. Kemisk og Mikrobiologisk Laboratorium benytter traditionel dyrkning såvel som DNA-hurtigmetoder, og metoderne benyttes enkeltvis eller i kombination, alt efter hvilke spørgsmål undersøgelserne skal besvare.

De standardopgaver, som laboratoriet udfører, er fx:

Identifikation af bakterier i en prøve. Formålet er at identificere de bakterier, som findes i en prøve. I laboratoriet identificeres både bakterier, som kan dyrkes, og bakterier, som ikke umiddelbart er opdyrkelige. Identifikationen foregår ofte ved DNA-analyser, som identificerer bakterien ud fra dens genom. Coliform-id hører under disse analyser og bruges fx, hvis man har en positiv colilert-plade, og man ønsker at identificere de coliforme bakterier i et forsøg på at spore forureningskilden.

Mikrobiologisk populationsanalyse (Next Generation Sequencing, NGS). Metoden bruges til at karakterisere populationen af bakterier i en prøve vha. deres DNA-sekvens og kan således give et øjebliksbillede af, hvilke bakterier der findes i en given prøve. Ofte benyttes metoden (som er mere omfattende og tidskrævende end simpel identifikation) til at sammenligne/følge bakteriesammensætningen i prøver over tid og sted. Om bakterierne kan dyrkes, har ingen indflydelse på analysens resultat.

Identifikation af den relative mængde levende versus døde bakterieceller. Laboratoriet benytter en PMA-qPCR-metode til at bestemme den relative mængde døde celler i en prøve. PMA er et farvestof, som binder til DNA fra døde celler, og som kan inhibere qPCR-reaktionen. Dvs. at man ved at sammenligne qPCR-resultater fra prøver med og uden PMA kan kvantificere den relative mængde af levende celler.